La Métropole Aix-Marseille-Provence est gouvernée par le conseil de la métropole. Celui-ci compte 240 conseillers issus des six territoires. Il élit son président qui est également à la tête d’un bureau de 36 membres au total dont 20 vice-présidents élus, 6 vice-présidents de droit.
Il s’appuie sur trois instances consultatives : la conférence métropolitaine des maires, le conseil de développement et dernièrement le Conseil des jeunes métropolitains.